2014年6月25日，为响应国家海洋强国战略和中央建设新型智库的指示精神，北大海洋研究院成立“海洋战略研究中心”。中心依托海洋研究院，致力于调动学校人文社科院系师资力量的广泛参与，利用北大的独特优势进行资源通配、协同发展，力争促进北大多学科交叉研究和相关学科的发展，服务于国家涉海战略与政策。

2014年6月至2017年12月，法学院李鸣教授任中心创始主任，历史系包茂红教授任副主任。

2018年至今，海洋战略研究专家胡波担任中心主任。

中心成立以来，聚焦海洋战略与政策、南海问题、中美关系等重大战略性议题，取得了显著成绩。